64個博士“眾籌”基因大數據剖析,識基因尋“癌”蹤

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【內容擇要】基因測序是國際公認的基因檢測尺度。作為精準醫療的主要手腕,基因測序能鎖定小我病變基因。

賽福基因開創人餘偉師

基因測序是國際公認的基因檢測尺度。作為精準醫療的主要手腕,基因測序能鎖定小我病變基因。

在10年前,基因測序本錢約為幾十億美金;5年前喬佈斯得胰腺癌之時,做全基因測序的用度已降到瞭十萬美金;到2015年,全基因測序本錢進一步降到瞭1000美金。

固然基因測序本錢的降低速率異常快,但對基因數據的剖析還沒有跟上。

每一個人都有23000多個基因,響應的全基因測序數據成果可達幾百GB到1TB之間。若何在基因突變與已知疾病之間樹立幹系,須要基因大數據與疾病大數據之間的相幹性剖析。這難在一方面須要大數據剖析才能,另外一方面還須要跨學科常識指點。

數據剖析須要一個數學模子作為初始出發點,再用大數據對這個數學模子賡續舉行優化。對付數據剖析來講,有三個通用數學模子:統計模子、神經收集和專傢常識體系。個中前兩者傾向純數學方法且須要海量盤算,而專傢常識體系則聯合瞭行業專業常識,在進步剖析效力的同時削減瞭盤算量。

十年前,還在讀碩士的餘偉師就已開端研討基因與疾病、基因與癌癥的幹系。他於2005至2010年前後在國際著名雜志上揭櫫瞭7篇基因表達與康健及疾病相幹的論文。2010歲尾,餘偉師從華東師大生物醫學專業博士卒業後,進入美國國立衛生研討院NIH處置博士後研討。

餘偉師在一向在思慮若何將本身研討瞭10多年的基因常識進獻給海內的醫療康健奇跡。其時美國的基因數據剖析正發達成長,而中國在這方面還很沒有成熟——本錢高、時效低、缺少中國人本身的基因數據庫。而針對疾病特別是癌癥的龐雜性,還必需與更多交織學科的專傢,一路辦理臨床碰到的題目。

餘偉師從這個思緒動身漸漸集合瞭64位華人博士,傍邊沒有乏頂尖機構的傳授。64位華人博士湊在一路做甚麼呢?簡略說,就是在本身的事情之餘,把醫學相幹文獻裡關於某基因突變與某疾病(以腫瘤為主)之間的潛伏幹系網絡起來,構成一個專傢常識庫。然後再把這類潛伏對應幹系,與美國現有臨床成果作印證,構建成專業的數據庫。

經由兩年多的盡力,這個團隊已把大眾數據裡癥結的疾病信息都匯集出來並舉行瞭考證。該數據庫已找出瞭11000多個與腫瘤疾病相幹聯的基因和相對應的位點,也就是說已整合瞭人體一半以上的基因,別的的還處於未知階段。

64
位博士之以是經由過程類「眾籌」的方法樹立這個專傢常識數據庫,最後的動力是在瀏覽和摘錄醫學文獻的時刻須要專業的鑒別才能。縱然是某個醫學專業的博士,假如程度不敷或是在某個疾病范疇研討不敷透,都沒法鑒別文獻中結論的精確性。而這64個博士在分歧醫學和疾病范疇各有特長,是以具有專業篩查才能。

當餘偉師的團隊帶著本身的科研結果返國交換時,連忙就遭到瞭海內醫療機構和第三方磨練所的留意,團隊所控制的技巧在互助單元舉行瞭充足實驗,並獲得主動的反應。因而,餘偉師廢棄瞭馬上申請下來的2016年150萬美圓的NIH小我研討經費和提升NIH研討員的機遇,還廢棄瞭申請中的美國綠卡,返國創業建立瞭賽福基因公司。

賽福基因有著壯大的專傢部隊,其技巧總監為耶魯大學運用數學博士,在美國俄亥俄州立大學終年處置生物信息學剖析,具有深摯的數學功底、豐碩的生物信息剖析履歷。賽福基因的市場總監為美國俄亥俄州立大學博士,在美國處置瞭近二十年的膀胱癌研討。2016年還將有20餘位醫學博士返國參加賽福基因,同時也將與美國各大醫學科研機構構成深度互助,經由過程眾籌互助配合推動精準醫療技巧成長。

賽福基因聯合雲盤算技巧,以基於智能機械進修的方法,主動化地為病院康健類B端客戶供給基因大數據剖析。賽福基因今朝重要與海內三甲病院和癌癥范疇頂尖病院互助,這些病院聚集瞭海內比擬威望的樣本庫,與賽福基因的基本數據庫聯合起來後,對樹立中國人本身的疾病基因數據庫將起主要感化。

賽福基因於2015年下半年參加瞭微軟創投加快器,今朝已完整天使輪融資。

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